Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TpoP35419 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TpoP35419 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TpoP35419 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TpoP35419 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TpoP35419 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TpoP35419 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TpoP35419 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms