Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PvalbP32848 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms