Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VtnP29788 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms