Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxraP28700 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RxraP28700 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RxraP28700 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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