Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb9P28076 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms