Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb2P27090 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms