Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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