Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PdgfaP20033 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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