Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NefhP19246 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NefhP19246 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NefhP19246 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NefhP19246 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NefhP19246 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NefhP19246 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NefhP19246 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NefhP19246 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NefhP19246 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms