Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb1P17919 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms