Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms