Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms