Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms