Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb1P09055 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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