Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms