Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ifna6P07350 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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