Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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