Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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