Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01727 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01727 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01727 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01727 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms