Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01643 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01643 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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