Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ifnb1P01575 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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