Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfi1bO70237 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms