Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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BckdkO55028 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BckdkO55028 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BckdkO55028 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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BckdkO55028 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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