Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DffaO54786 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DffaO54786 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms