Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FxnO35943 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FxnO35943 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FxnO35943 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms