Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NmiO35309 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms