Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ptpn9O35239 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptpn9O35239 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn9O35239 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms