Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms