Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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