Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms