Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20939L7N243 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms