Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms