Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3685J3QPP2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms