Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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