Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3415J3QMS8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm3415J3QMS8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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