Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20834J3QM72 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms