Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6594J3QM43 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms