Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm20828J3KMI7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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