Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn20G5E8X0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn20G5E8X0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn20G5E8X0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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