Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp17lcG5E8I7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp17lcG5E8I7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms