Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arfgef1G3X9K3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arfgef1G3X9K3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arfgef1G3X9K3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arfgef1G3X9K3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arfgef1G3X9K3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arfgef1G3X9K3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms