Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms