Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Zfp988F6VKC7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Zfp988F6VKC7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Zfp988F6VKC7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Zfp988F6VKC7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Zfp988F6VKC7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Zfp988F6VKC7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms