Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atf6F6VAN0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms