Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21977F6U3N7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms