Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms