Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms