Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh8D3Z6W3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms