Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms