Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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BC048679D3YXE9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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